May be you have very bad disk access times (e.g. slow random access)? In this case everything should be OK while data in cache and awful, when not. Could you check disk IO speed && IO wait while doing slow & fast query.
BTW: In this case, increasing shared buffers may help. At least this will prevent other applications & AFAIK sequence scans to move your index data from cache.
Сайт использует файлы cookie для корректной работы и повышения удобства. Нажимая кнопку «Принять» или продолжая пользоваться сайтом, вы соглашаетесь на их использование в соответствии с Политикой в отношении обработки cookie ООО «ППГ», в том числе на передачу данных из файлов cookie сторонним статистическим и рекламным службам. Вы можете управлять настройками cookie через параметры вашего браузера